Desde martes 25 de noviembre hasta domingo 14 de diciembre, el túnel Chilebiogeográfico poniente estará cerrado por trabajos. Sigue disponible el Salón Central (excepto el esqueleto de ballena, que está en obras) y el túnel oriente.
Desde 2009 el Museo Nacional de Historia Natural ha desarrollado exposiciones temporales que ponen en valor colecciones de las distintas áreas del Museo.
- 2009-2010: Panubis, del antiguo Egipto a la Eternidad
- 2011-2012: Grandes Extinciones
- Primer Semestre 2013: Cuando Santiago era Mapocho
- Segundo semestre 2013: Gonfoterios, del imaginario a la ciencia
- Primer semestre 2014: El pequeño mundo de las plantas briófitas
- Segundo Semestre 2014: Margot Loyola: un poco campesina, un poco maestra, un poco cantora
- Primer semestre 2015: Hongos, un reino por descubrir.
- Primer semestre 2016: Cetáceos, de la tierra al mar.
- Segundo semestre 2016: Lagartijas y coleópteros: reflejos del cambio.
- Primer semestre 2017: Dinosaurios: más allá de la extinción.
- Primer semestre 2018: Chinchorro: trascender a la muerte.
- Primer semestre 2019: Humedales: refugios de la vida en peligro.
- 2021: ¿Pepinos de mar? Sí, pepinos de mar.
- 2022: Taxidermia: arte, ciencia, paciencia
- 2022: Opiliones de Chile: ni arañas ni cangrejos
- 2023: El viaje de Guan Gong
- 2023: Mucho más que monos, primates en el MNHN
- 2024: Dinosaurios del sur del mundo
- 2025: Mariposas y polillas, colores en movimiento.
